COVID-19, animaux de compagnie et autres animaux

Les chats et les chiens peuvent-ils contracter le COVID19 ?

La réponse courte est que les chats sont particulièrement sensibles à l’infection par le SRAS-CoV-2 et sont capables de la transmettre et de la contracter par les humains. Les chiens sont moins sensibles aux infections, mais ils en sont capables. Des recherches supplémentaires sont nécessaires pour déterminer la probabilité que les chiens transmettent le virus ou le contractent auprès des humains. De nombreux autres animaux sont également sensibles à l’infection, certains très sensibles, d’autres moins, et, sur la base des deux derniers articles discutés ci-dessous, tous les vertébrés devraient être présumés sensibles à moins qu’il n’existe des preuves solides qu’ils ne peuvent pas être infectés. Ainsi, si vous êtes mis en quarantaine ou en auto-isolement, votre animal doit également être mis en quarantaine et auto-isolé (avec vous ou séparé de vous selon vos conditions de vie et d'isolement), afin d'éviter toute propagation à d'autres. De la même manière, vous devez observer la même distance et les mêmes précautions pour votre animal que pour vous-même afin de protéger votre animal. Et surtout, ne caressez pas l'animal de compagnie d'autrui ou un animal errant, surtout un chat !

La réponse longue est que nous savons que de nombreuses espèces animales sont sensibles à l’infection par le SRAS-CoV-2. Après tout, le virus est originaire d’une espèce de chauve-souris (la chauve-souris fer à cheval) et s’est très probablement propagé jusqu’aux humains via un animal intermédiaire qui vit à proximité de cette chauve-souris. De récents rapports très fiables ont également confirmé la transmission de l'homme aux tigres et aux chiens. Et maintenant, nous avons des études qui confirment également que les furets, les chats et les chiens sont tous sensibles à l’infection par le SRAS-CoV-2 (le virus qui cause le COVID-19) et qui suggèrent qu’un éventail beaucoup plus large d’animaux est également susceptible d’être sensible. . (Je note d'emblée qu'aucun des articles discutés ici n'a encore été formellement évalué par des pairs et n'est disponible que sous forme de pré-impressions. Cependant, ils impliquent chacun plusieurs auteurs (une sorte d'examen par les pairs en soi) et sont généralement considéré comme fiable.)

La première étude , publiée le 31 mars 2020, impliquait une série d'expériences sur des animaux vivants : furets, chats, chiens, porcs, poulets et canards. Pour les chiens (les beagles, dans ce cas), les porcs, les poulets et les canards, cinq de chaque animal ont été inoculés par voie nasale avec le SRAS-CoV-2 et hébergés avec deux animaux non inoculés. Des écouvillons nasaux et rectaux ont été prélevés tous les deux jours pendant 14 jours et un test d'anticorps (sérologique) a été effectué le 14e jour. À l'exception des chiens, aucun de ces animaux n'a été testé positif ni pour l'ARN viral ni pour les anticorps, ce qui indique qu'aucun de ces animaux a été infecté bien qu’il ait été vacciné avec le virus. Cela suggère que ni les porcs, ni les poulets, ni les canards ne sont particulièrement sensibles à l’infection, du moins par voie intranasale. (Bien sûr, il s’agit d’un échantillon de très petite taille et la sensibilité n’est pas un concept de choix, mais plutôt une question de degré, la prudence est donc de mise.)

En ce qui concerne les chiens, aucun des chiens non inoculés n’a été testé positif ni à l’ARN viral ni aux anticorps, ce qui signifie que la transmission de chien à chien ne s’est pas produite dans ce petit échantillon. Pour les chiens inoculés, trois positifs à l'ARN viral sur leurs prélèvements rectaux (au jour 2 pour deux des chiens et au jour 6 pour le troisième) et deux ont été testés positifs aux anticorps. L’un des chiens positifs à l’ARN viral a été euthanasié au jour 4 et plusieurs de ses organes et tissus ont été testés. Aucun des tissus ou organes testés n’était positif pour l’ARN viral. Ces résultats suggèrent que les chiens (au moins les beagles) sont sensibles à l’infection, bien que peut-être pas très sensibles. Compte tenu du petit nombre de chiens utilisés dans cette expérience et à la lumière du rapport de Hong Kong mentionné ci-dessus, des études supplémentaires seraient nécessaires pour exclure la possibilité d'une relation de chien à chien (ou de chien à humain, ou vice versa). transmission. Cela reste donc une question ouverte.

Les expériences sur les chats et les furets étaient plus complexes et comprenaient des expériences supplémentaires. Pour les chats, 5 ont été inoculés avec le virus, et un chat non inoculé a été placé dans une cage à côté de chacun des chats inoculés. Deux des chats inoculés ont été euthanasiés au sixième jour et le virus infectieux a été trouvé dans plusieurs tissus (principalement dans la région nasale et juste en dessous). Au jour 5, les trois autres chats inoculés et l’un des chats non inoculés avaient de l’ARN viral dans leurs selles. Tous les chats restants porteurs d’ARN viral ont été euthanasiés au jour 11 et de l’ARN viral a été trouvé dans plusieurs tissus. Les chats restants ont été euthanasiés le lendemain et de l’ARN viral a été trouvé dans plusieurs de leurs tissus. Deux des chats exposés et non vaccinés étaient les seuls à ne pas avoir été testés positifs à l'ARN viral. L’un d’eux a été testé positif aux anticorps. Ces résultats suggèrent (a) que les chats sont très sensibles à l’infection par le SRAS-CoV-2, et (b) qu’ils sont capables de la transmettre entre eux via des gouttelettes respiratoires (et, par extension, aux humains ou autres).

Les expériences sur le furet différaient à plusieurs égards des autres expériences. Par exemple, ils n’ont pas placé de furets non inoculés à côté de furets inoculés pour évaluer la transmissibilité. Un virus infectieux a été trouvé chez tous les furets (inoculés) et ils ont tous développé des anticorps. Les chercheurs ont également prélevé des échantillons de divers tissus et ont conclu que le virus peut se répliquer dans les voies respiratoires supérieures du furet mais pas dans les autres organes échantillonnés. Ces résultats suggèrent que les furets sont très sensibles au SRAS-CoV-2, mais aucune conclusion sur la transmissibilité entre furets ne peut être tirée de cette étude.

La deuxième étude a été publiée le 18 avril 2020. Il s’agissait d’une étude d’un type totalement différent. Aucun animal n'a été blessé lors de cette exécution. Une grande équipe de chercheurs du monde entier et ses principales universités et centres de recherche ont examiné les séquences d'ADN de 410 vertébrés pour évaluer si leurs cellules contenaient les produits chimiques appropriés pour permettre l'infection.

Plus précisément, une enzyme appelée enzyme de conversion 2 de l'angiotensine I (ACE2) se trouve sur la membrane de diverses cellules situées dans tout le corps humain, notamment dans les poumons, le tractus gastro-intestinal, les testicules, le cerveau et de nombreux autres sites. Le SRAS-CoV-2 présente, entre autres structures, des « pointes » à sa surface. Si vous avez vu une illustration ou une image du virus (ou de tout autre coronavirus), ce sont les centaines d'appendices que vous voyez sortir de la structure sphérique qui lui donnent son apparence et son nom en forme de couronne. Lorsque l’une de ces pointes entre en contact avec ACE2 (et uniquement ACE2), elles se collent les unes aux autres. Étant donné que l’ACE2 se trouve sur la membrane cellulaire, le virus peut l’utiliser comme point d’entrée à l’intérieur d’une cellule et peut soit injecter son ARN dans la cellule, soit s’enfouir dans la cellule. (Et l’inverse est également vrai : sans la liaison du pic ACE2, il ne peut y avoir d’infection, c’est pourquoi la plupart des vaccins en cours de développement ciblent spécifiquement le pic.) Une fois à l’intérieur, il peut faire son travail normal en matière de virus : -écrire le logiciel de la cellule pour produire davantage de virus afin de favoriser sa propagation et sa reproduction dans le corps et vers de nouveaux hôtes.

Les acides aminés clés sur les pointes se lient à des degrés plus ou moins importants avec les acides aminés homologues sur l'ACE2. Plus ces acides clés entrent en contact avec leurs homologues liants et plus la liaison formée lors d’un tel contact est forte, plus l’infection est susceptible de se produire. Les humains ne sont pas les seuls animaux à avoir l’ACE2. En fait, de nombreux vertébrés (peut-être tous ?) ont une version d’ACE2 dans leur corps. Cependant, en raison de leurs chemins évolutifs distincts, la plupart des versions d’ACE2 sont constituées d’acides aminés différents de ceux de l’ACE2 humain. Certaines de ces différences sont sans importance : l’acide aminé substitué est tout aussi « collant » que la version humaine. D'autres substitutions peuvent en fait repousser leurs homologues dans le pic. Et bien d’autres substitutions se situeront quelque part entre ces deux extrêmes. Une autre considération encore est que certaines combinaisons d’acides aminés semblent être plus importantes que d’autres pour assurer une liaison entre ACE2 et un pic.

Dans cette étude, les auteurs ont examiné l'ADN des versions d'ACE2 possédées par 410 espèces de vertébrés uniques pour déterminer à quel point la correspondance était étroite, si les substitutions étaient plus susceptibles de se lier ou de repousser leurs homologues et si des acides aminés plus critiques étaient présents, dans afin d'estimer la probabilité que la version ACE2 d'un animal particulier se lie au pic du SRAS-CoV-2. Ils ont ensuite attribué à chaque espèce l’une des cinq catégories de probabilité de sensibilité allant de « très élevée » à « très faible ».

Les résultats sont présentés à la page 25 de la pré-impression et ils sont fascinants. Tout d’abord, vous devez noter qu’il n’y a pas beaucoup de différence dans l’ACE2 au sein des différents animaux de la même famille taxonomique (à l’exception des chauves-souris, dont nous parlerons dans le prochain article) ou même entre des familles étroitement apparentées. Ainsi, par exemple, en ce qui concerne les acides aminés de liaison critiques affichés dans le tableau, l’ACE2 humain est identique à celui de presque tous les singes, gorilles, bonobos, singes et autres primates étudiés. Les trois espèces de chameaux étudiées avaient un ACE2 identique, tout comme les ânes et les chevaux. (Ce modèle apparaît également dans la troisième étude, discutée ci-dessous.) De là, nous ne devrions pas nous attendre à beaucoup de variation dans la susceptibilité, disons, d'une race de chien ou de chat à une autre.

Voici quelques-uns des résultats concernant certains des animaux avec lesquels les humains interagissent souvent (que ce soit comme animaux de ferme ou comme animaux de compagnie) :

--Catégories de sensibilité très élevée ou élevée--Je n'ai reconnu aucun animal de compagnie ou de ferme dans cette catégorie.

--Catégorie de sensibilité moyenne : vaches, chèvres, chats et moutons.

--Catégorie de faible sensibilité : chiens, ânes, chevaux et porcs.

--Catégorie de sensibilité très faible : les furets et, fait intéressant, la chauve-souris fer à cheval, qui serait l'espèce spécifique de chauve-souris à l'origine du SRAS-CoV-2.

Puisque nous savons, grâce à la première étude, que les furets sont en fait très sensibles et, grâce à d'autres recherches, que les chauves-souris fer à cheval peuvent contracter et propager le SRAS-CoV-2, le fait qu'ils soient parmi les animaux les moins sensibles nous indique soit que presque tous les vertébrés sont susceptibles d’être sensibles ou que la liaison ACE2/spike n’est pas toute l’histoire. Je soupçonne que la réponse est les deux. Par exemple, certains animaux sensibles ne sont pas aussi susceptibles de le propager car ils n'excrétent pas le virus de la même manière. Les chats toussent, éternuent, se lèchent et sifflent et les chiens aboient. . . directement les uns aux autres même. . . souvent en même temps les uns que les autres. Tous ces éléments constituent probablement de meilleurs moyens de transmission que les reniflements ou les « paroles » occasionnels d'un cheval, qui ne s'adressent souvent à rien ni à personne en particulier. Les vaches meuglent, mais pas nécessairement avec la même force qu'un aboiement de chien ou un sifflement de chat et en aucun cas en direction d'une autre vache ou d'une autre personne. Il y a sans aucun doute d’autres facteurs à l’œuvre également.

La troisième étude , publiée le 20 avril 2020, s'apparente à la deuxième dans la mesure où elle s'appuie sur les génomes de plusieurs espèces. Cependant, cette étude s’est particulièrement concentrée sur l’origine du virus (et du précédent SARS-CoV-1) : les chauves-souris. L’idée maîtresse du troisième article est que l’ACE2 chez les chauves-souris a évolué beaucoup plus rapidement que chez les autres animaux, ce qui suggère qu’elles sont particulièrement sensibles à une gamme de virus du SRAS-CoV et qu’elles s’y sont adaptées au fil du temps. La figure 1 le montre de façon spectaculaire, car le tableau de gauche (montrant d'autres animaux) comporte beaucoup plus d'espace blanc (indiquant une correspondance ou une correspondance étroite) que celui de droite (montrant uniquement les espèces de chauves-souris), même au premier coup d'œil. Les résultats montrent que, bien qu’il existe très peu de variations interspécifiques parmi les espèces évolutivement proches (les humains et les bonobos, par exemple), il existe une grande diversité dans l’ACE2 parmi les 90 espèces de chauves-souris différentes examinées. La figure 1 (vers la fin de l'article) rapporte les résultats de leur étude multi-espèces de sept résidus d'acides aminés critiques de liaison au pic ACE2 et rapporte des variations par rapport aux résidus d'acides aminés du pic ACE2 humain. (Les « résidus » d’acides aminés sont simplement l’acide aminé d’origine, moins les produits chimiques qu’il perd lorsqu’il se joint à un autre acide aminé.) Dans leur modèle, seuls deux résidus de pointes ACE2 de renard, de loup, de chat ou de furet variaient de l’ACE2 humain ( dont l'un n'était pas significativement différent). (Je ne pense pas qu'ils incluent les résidus de chien, j'ai donc inclus le renard et le loup à titre d'approximation.) Les résidus de pointes ACE2 de vache et de porc ne variaient que dans un seul des résidus. De nombreuses autres espèces détaillées dans la figure 1 semblent différer peu de leurs homologues humains et peuvent donc être sensibles à l'infection par le SRAS-CoV-2.

Ainsi, de nombreux animaux sont probablement sensibles au COVID-19 et sont probablement capables de transmettre ou de contracter le virus qui le provoque. Bien que ces résultats aient de nombreuses implications, la plus immédiate est d'observer toutes les distances recommandées et autres précautions applicables qui s'appliquent également à vous pour votre animal de compagnie et d'éviter tout contact (à la fois pour vous et votre animal) avec des animaux qui ne sont pas les vôtres.